转基因菜籽油由于有化学成份在里面，再加上多数通过浸出方式榨出来的油，对人体有害。转基因食品对人的影响短期内没有危害，但潜在和长期影响仍是个待解之迷。所以不论是在中、外，不论民间或科学界，对转基因食品都分为正、反两派。 美国是生产转基因玉米、大豆、菜籽油最多的国家，但美国人对转基因的争论没有中国人激烈，民间很少有人关心是否转基因。我国对转基因的态度很慎重，要求生产者有义务告知消费者自己的产品是否是转基因，给消费者以知情权和选择权：你可以选择吃，也可以选择不吃。

　　基因油菜籽是通过基因工程技术将某种植物或动物及微生物的基因转移到普通油菜中，使油菜籽具有了相应的基因，这种油菜籽是转基因油菜籽。

　　转基因菜籽油就是转基因菜籽制作的菜籽油，这种菜籽油的出油率高。

　　非转基因菜籽是指我国原先有的一些菜籽品种，这种菜籽产是要低些，出油率要低一些。

　　转基因菜籽油由于有化学成份在里面，再加上多数通过浸出方式榨出来的转基因菜籽油对人体有害;而非转基因菜籽油对人体无害。这就是它俩的本质区别。